本文微视频分两部分,第一部分为非共轭体系,时长19分钟36秒;第二部分为共轭体系,时长15分钟56秒;从甲烷、乙烷、乙烯、丙烯、乙炔、2-丁炔、环己烷、苯、甲苯、乙苯、石墨烯、1,3-丁二烯、吡咯、卟啉等经典分子结构出发,利用三维虚拟技术动态演示杂化轨道的形成、σ键的旋转、共轭与离域效应等因素对分子(或晶体)结构的影响,以此解读分子(或晶体)结构中原子共平面、共直线问题。演绎直观形象,讲解简明扼要,富有启发性,文末附有思考题。

第一部分 非共轭体系

本段视频涉及的结构有甲烷、乙烷、乙烯、丙烯、乙炔、2-丁炔、环己烷等分子。

第二部分 共轭体系

本段视频涉及的结构有苯、甲苯、乙苯、石墨烯、1,3-丁二烯、吡咯、卟啉等分子。

以下文字材料供参考。

讨论分子(或晶体)结构中原子是否共平面、共直线,有机化合物的碳架是关键,而有机化合物的碳架是以碳碳单键、碳碳双键、碳碳叁键为基本结构单元构建而成的。因此,解决这个问题的方法是:

第一,掌握几种含碳碳单键、碳碳双键、碳碳叁键的简单有机物如甲烷、乙烯、乙炔、苯、环己烷、吡咯等分子的空间构型,以其为母体模型并从结构上将其衍变至复杂有机物(或晶体)结构中,有助准确判断原子是否共线共面。

第二,以母体模型为基准,注意从母体到衍生体原子或基团之间的连接方式,单键能旋转,而双键、叁键不能旋转。

第三,注意共轭效应对分子与晶体结构的影响,避免机械套用路易斯结构式和VSEPR模型预测某些分子结构可能带来的误判。

第一部分非共轭体系

1、甲烷分子的空间构型

甲烷是最简单的烷烃,分子式为CH4。CH4分子中C原子采用sp3杂化,4个sp3杂化轨道分别指向四面体4个顶点,每个sp3杂化轨道上具有一个未成对电子,与H原子1s上未成对的电子沿轨道对称轴方向互相重叠形成4个等同的C—Hσ键,故CH4分子结构为正四面体,C原子位于正四面体中心,4个H原子位于正四面体的4个顶点,键角109°28′,显然CH4分子中C原子和4个H原子不能共面,这5个原子中只有3个原子共面(图1)。

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图1 CH4分子的sp3杂化与正四面体结构

若用Cl原子取代CH4分子中的H原子得到氯代甲烷,为满足原子轨道最大程度重叠,Cl原子是沿C—Hσ键方向取代H原子的,故氯代甲烷分子中的键角与CH4分子中键角相似,因此,除了键长发生变化外,氯代甲烷依然是四面体结构,5个原子中只有3个原子共面。

若用一个甲基取代CH4分子中的一个H原子得到乙烷,分子式为C2H6,C2H6分子中两个C原子均采用sp3杂化,每个C原子的3个sp3杂化轨道分别与3个H原子的1s轨道重叠形成C—Hσ键;两个C原子各以1个sp3杂化轨道发生重叠形成C—Cσ键。

σ键能围绕对称轴自由旋转,因为旋转不会影响原子轨道的重叠程度,因而不会影响轴间夹角和键的强度。当C2H6分子以C—Cσ键为轴进行旋转时,两个相邻碳原子上的C—H键会交叉成一定的角度θ,这个角度称为二面角。单键旋转一周,可以产生无数个构象异构体,二面角为0°的构象称为重叠型,此时两个氢原子核间距最小,排斥力最大,体系最不稳定;二面角为60°的构象称为交叉型,此时两个氢原子核间距最大,排斥力最小,体系最稳定。从单键旋转一周过程可以观察到C2H6分子中8个原子最多4个原子共面。

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图2 C2H6分子中的二面角θ及重叠与交叉型构象

C2H6可看作CH4分子中的一个H原子被一个甲基取代,而丙烷可看作CH4分子中的2个H原子被二个甲基取代,或可看作C2H6分子中的1个H原子被一个甲基取代……依次类推,形成烷烃的碳原子均为sp3杂化的C原子,它们都具有四面体的结构特征,CH4是烷烃的母体模型。

2、乙烯分子的空间构型

乙烯是最简单的烯烃,分子式为C2H4。C2H4分子中C原子均采用sp2杂化,3个sp2杂化轨道位于同一平面,每个C原子各用2个sp2杂化和2个H原子1s轨道形成C—Hσ键,各用1个sp2杂化轨道彼此重叠形成C—Cσ键,5个σ键处在同一平面上,所以乙烯分子呈平面型结构,2个C原子与4个H原子均在同一平面,C—Hσ键之间以及C—Hσ键与C—Cσ键之间夹角均接近120°。

2个碳原子各剩下一个p轨道,这两个p轨道垂直于σ键所在的平面,且相互平行,因此这两个p轨道可以通过侧面重叠形成π键,C2H4分子的碳碳双键是由一个σ键和一个π键形成的,π键由于通过侧面重叠形成,重叠程度小于σ键,所以较易断裂,但π键不能绕轴自由旋转,因为旋转会使两个p轨道离开平行状态,从而破坏p轨道电子云的重叠。

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图3 C2H4分子的sp2杂化与平面型结构

丙烯分子(分子式C3H6)可以看作C2H4分子中1个H原子被甲基取代得到的产物,因此丙烯分子中3个C原子及3个与不饱和C原子直接相连的H原子一定在同一平面,由于连接甲基的C—Cσ键可以旋转,观察演示可知,通过C—Cσ键的旋转,甲基上最多有1个H氢原子与碳碳双键共平面,另外2两个H原子分居这个平面的两侧。即丙烯分子的9个原子中,一定有6个原子共平面,在此基础上通过σ键旋转,最多有7个原子共平面(图4)。

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图4 丙烯分子最多有7个原子共平面

基于C2H4的平面结构和脱胎于CH4的甲基的四面体构型,再考虑σ键的旋转,我们可以很好认识丙烯的分子结构……依次类推,C2H4碳碳双键的平面型结构奠定烯烃分子结构的特征,故C2H4是烯烃的母体模型。

3、乙炔分子的空间构型

乙炔是最简单的炔烃,分子式为C2H2。C2H2分子中C原子均采用sp杂化,2个sp杂化轨道位于同一直线,每个C原子各用1个sp杂化和一个H原子1s轨道形成C—Hσ键,各用1个sp杂化轨道彼此重叠形成C—Cσ键,因此C2H2分子中的4个原子都处在同一直线上,所以C2H2是直线型的分子。同一C原子上的2个p轨道上的电子云互相垂直,也与C—Cσ键的对称轴垂直。2个相邻C原子的p轨道两两平行,侧面重叠形成两个相互垂直的π键,C2H2分子的碳碳叁键是由1个σ键和2个相互垂直的π键组成。

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图5C2H2分子的sp杂化与直线型结构

2-丁炔分子可以看作C2H2分子中2个H原子分别被两个甲基取代得到的产物,因此2-丁炔分子中4个C原子一定在同一直线上。虽然连接甲基的碳碳σ键可以旋转,由于甲基是四面体结构,故甲基上的三个H原子不可能与4个碳原子位于同一直线,却可以旋转出最多2个H原子与4个C原子位于同一平面。即2-丁炔分子的10个原子中,一定有4个原子且均为C原子在同一直线,H原子不可能与4个C原子位于同一直线,通过σ键旋转,最多有6个原子共平面。

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图62-丁炔分子中4个C原子在同一直线

图72-丁炔分子中最多有6个原子共平面

基于C2H2的直线结构和脱胎于CH4的甲基的四面体构型,再考虑σ键的旋转,我们可以很好认识2-丁炔的分子结构……依次类推,C2H2碳碳叁键的直线型结构奠定炔烃分子结构的特征,故C2H2是炔烃的母体模型。

4、环己烷分子的空间构型

环己烷的分子式为C6H12,环己烷中的6个C原子采用sp3杂化乙烯结构简式,所以环己烷的6个C原子不在同一平面,随着碳碳单键的旋转,环己烷可以产生无数个构象异构体,其中最为典型的构象是椅型和船型两种折叠的环系,在这两个环系中,C原子可以保持sp3杂化的正常键角。

环己烷的椅型构象是一个非常对称的结构,因为形似一把椅子而得名。环中的C原子处在一上一下的位置。向上的三个碳原子[C(1) C(3) C(5)]组成的平面和向下的三个碳原子[C(2) C(4) C(6)]组成的平面平行,两个平面的间距为50pm。环己烷的椅型构象最多有4个C原子[C(1)C(2)C(4)C(5)]在同一平面上(图8)。

在环己烷的椅型构象中,碳碳单键的键长和碳的键角都与正常的碳碳单键的键长及碳的sp3杂化的键角相符,因此这种构象既无键长变形引起的内能升高,也无角张力,是环己烷的优势构象,金刚石中的最小碳环六元环就是采用椅型构象,这也是金刚石结构牢固原因之一。

环己烷的船型构象中的C(2)、C(3)、C(5)、C(6)处在同一平面,好像一个船底(图9)。C(1)和C(4)都处在平面的上方,一个可看做船头,另一个可看做船尾乙烯结构简式,船头与船尾向内的C—H键的H原子距离太近有排斥力,故相对椅型构象,船型构象更不稳定,根据计算,椅型构象比船型构象能量低28.9kJ·mol-1。

图8环己烷的椅型(左)与船型(右)构象

第二部分共轭体系

5、苯分子的空间构型

苯是最简单的芳香烃,分子式为C6H6。C6H6分子中6个C原子均采用sp2杂化,3个sp2杂化轨道位于同一平面,每个C原子各用1个sp2杂化轨道和1个H原子1s轨道形成C—Hσ键,各用2个sp2杂化轨道彼此重叠形成C—Cσ键,12个σ键处在同一平面上,所以苯分子呈平面型结构,6个C原子与6个H原子均在同一平面,6个C原子组成一个正六边形,碳碳键长均相等,所有的键角均为120°。

图9 苯分子的sp2杂化与平面型结构

每个C原子各剩下1个p轨道,这6个p轨道垂直于σ键所在的平面,且相互平行,因此这6个p轨道可以通过侧面重叠形成一个离域π键(离域π键指包括了3个或3个以上的C原子或其他杂原子间形成的化学键)。

值得注意的是,苯分子中对位的4个原子在同一直线上。

用甲基取代苯分子中的H原子得到甲苯,所以甲苯分子的15个原子中,一定有12个原子在同一平面,通过甲基与苯环连接的碳碳单键的旋转,最多有13个原子在同一平面。再用甲基取代甲苯甲基上的1个H原子得到乙苯,分子式为C8H10,乙苯分子中最多有几个原子在同一平面呢?先通过直接与苯环连接的碳碳单键的旋转,确保乙苯分子中甲基中的C原子落在苯环所在平面,然后在通过亚甲基与甲基连接的碳碳单键的旋转,确保甲基中的1个氢原子落在苯环所在平面,则乙苯分子的18个原子中,一定有12个原子在同一平面,最多有14个原子在同一平面。

6、石墨烯结构

石墨烯就是单层的石墨,是由六角碳环构成的平面层,层中每个C原子以sp2杂化轨道与3个相邻的C原子形成等距离的3个σ键,构成无限伸展的平面层。每个C原子均有一个垂直于该平面、未参与杂化的p轨道,它们互相叠加形成离域π键。

图10 石墨烯是由六角碳环构成的平面层

7、1,3-丁二烯分子结构

1,3-丁二烯是最简单的共轭二烯烃,在1,3-丁二烯分子中,4个C原子都是sp2杂化,相邻C原子均以sp2杂化轨道沿轴向重叠形成C—Cσ键,其余的sp2杂化轨道分别与H原子的1s轨道形成C—Hσ键,由于每一个碳的3个sp2杂化轨道都处于同一平面上,所以1,3-丁二烯是一个平面型分子。每个C原子还有1个p轨道,这些p轨道均垂直于分子平面且彼此间互相平行重叠,形成一个离域的π键。

图11 1,3-丁二烯的键长、键角

相关理论计算表明,C(2)—C(3)的单键具有部分双键性质,但π电子在C(2)—C(3)上分布大约占总π体系的10%左右,双键性质不明显,所以C(2)—C(3)化学键可以转动产生无数个构象,其中最经典的是反式1,3-丁二烯与顺式1,3-丁二烯,常温下,二面角为180°的反式1,3-丁二烯约占98.54%,二面角为34°的顺式1,3-丁二烯约占1.22%,而二面角为0°的顺式1,3-丁二烯约占0.23%。

反式1,3-丁二烯是平面型分子,10个原子均在同一平面;而顺式1,3-丁二烯不一定是平面型分子。

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图12 反式与顺式1,3-丁二烯结构

8、吡咯结构

吡咯是含有1个N原子的五元杂环化合物,其分子式为C4H5N,结构式如图20所示,若根据路易斯结构式和VSEPR模型判断,4个C原子为sp2杂化,而N原子分别通过2个单键连接C原子,一个单键连接H原子,还剩余1对孤电子对,故N为sp3杂化,则吡咯不是平面型分子——这与事实矛盾!吡咯是平面分子,10个原子均在同一平面互联网项目,为什么呢?因为N的孤对电子参与五元环π键共轭(p-π共轭),形成离域π键,也就是N原子是sp2杂化。这样环中的C原子与N原子均以sp2杂化轨道互相连接成σ键,每个C原子及N原子上均有1个p轨道,这些p轨道均垂直于分子平面且彼此间互相平行重叠,C原子的p轨道中有1个p电子,在N原子的p轨道中有2个p电子,形成一个环状封闭的6π电子的共轭体系

。这提醒我们在使用路易斯式时应当注意,当分子内可能存在π-π共轭或者p-π共轭时,不能简单地用路易斯式和VSEPR模型判断其结构。

借助共轭概念,可以使我们更好地理解卟啉、吡咯和乙烯胺等分子的平面构型更稳定的特点,例如卟啉是四个吡咯环通过四个次甲基(—CH=)桥连接而成的共轭体系,呈平面型,分子中4个N原子均相同,均为sp2杂化。连接在N原子上的H原子其实在哪个N上都可以,可以存在反式(2个内氢原子处于对位)和顺式(2个内氢原子处于邻位)两种不同的平衡构型,H原子可以在不同的N原子之间迁移,发生内氢迁移反应。H原子处于对位时,能量稍低,所以通常把卟啉的内氢画成反式构型。

叶绿素、血红蛋白、维生素B12及胆色素等分子结构都与卟啉环有关,卟啉环系的化合物对生命而言极为重要。

图13 吡咯是平面型分子

图14 卟啉是平面型分子

思考题

1.某分子的结构为:

对于该分子结构的描述:

(1)一定在同一直线上的碳原子个数为______。

(2)位于同一平面内的原子数一定有 个,最多有______个。

2.下列有机分子中,所有的原子不可能处于同一平面的是( )

3.如图所示分子中14个碳原子不可能处在同一平面上的是()

4.化学式为C6H12的某烯烃的所有碳原子都在同一平面上,则该烯烃的结构简式为___________________;若分子式为C10H18的链烃分子中所有的碳原子也在同一平面上,它的结构简式为 。

5.描述CH3—CH=CH—C≡C—CF3分子结构的下列叙述中,正确的是( )

A.6个碳原子有可能都在一条直线上

B.6个碳原子不可能都在一条直线上

C.6个碳原子有可能都在同一平面上

D.6个碳原子不可能都在同一平面上

6.下图所示为血红蛋白和肌红蛋白的活性部分――血红素的结构式。回答下列问题:

血红素中N原子的杂化方式为,Fe2+的配位数为 。

7.呋喃的结构与吡咯相似,结构式如下:

则呋喃中O原子的杂化方式为 ,形成的大π键可标记为 。

参考答案

视频中的三维虚拟模型是氢剑采用互动式三维虚拟技术制作的。在相关插件支持下,用鼠标即可对结构模型进行平移、滚动、旋转、缩放、变形、增添或删除原子及触动预先设置的动画等操作。

说明:本公众号会不定期上传基于三维虚拟技术制作的晶体与分子结构模型微课,因2018年6月申请的个人公众号已经没有留言功能,各位可在后台留言。原创不易,未经作者同意,视频与图片不得用于任何以商业为目的的行为中。

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